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微生物中的“特種部隊”?|?院士科普

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您是否曾經想過一杯水里究竟有多少水分子?您是否思考過我們身邊還生存著許多看不見的生命?地球上的微生物,小得讓您難以想象,卻數量眾多。不僅如此,它們還有一個龐大的家族,既有介于化學分子與細胞生命之間的病毒,也有介于真菌與動物之間的黏菌,更有介于植物與動物之間的綠眼蟲等。如此看來,微生物就是一個矛盾的統一體,既渺小又龐大,既平庸又神奇。今日,我們帶您認識微生物大家族中的“特種部隊”——嗜極微生物

生命自從在地球上起源,就不斷地拓展其生態領地。有些微生物特別能折騰,它們不滿足于地表正常環境下索然無味的生活,嗜好徜徉在一些極端環境里。除了人們司空見慣的地球表層生物圈,微生物還向深部開疆擴土,私自建立了一支神秘的“特種部隊”——深部生物圈。深部生物圈是指分布在陸地表面以下、深部海洋或者海底沉積物以下,不依賴陽光為能量來源的生物圈。深部生物圈也被稱為黑暗生物圈,主要由嗜極微生物組成 。顧名思義,“嗜極”就是嗜好極端物理化學條件。這些微生物適應力極強,可以挑戰各種極限條件,堪稱微生物界的“特種部隊”。一般的微生物想在那里活下去還不是那么容易呢!目前,人們在地下3000~4000 米處分離出了一些新的極端微生物。當然,這個深度紀錄會不斷地被刷新。

其實,這支“特種部隊”生活的深部環境,就是一個黑暗、缺水、低氧、寡營養的“地下煉獄”,微生物能在那里存活,堪稱生命的奇跡。這微生物顯然身懷獨門絕技,個個武藝高強,它們因擁有特殊功能的酶,能應對各種有害的極端條件。在地下深部巖石中,能夠維系微生物生活的有機質極少,能量來源也極其匱乏,微生物如同武俠小說中的辟谷居士,“靜心養神”,緩慢地消耗食物。那么,它們的代謝能力到底有多強?研究發現,這些微生物的代謝速率要比表層系統的微生物緩慢得多。例如,大陸深部地下微生物要比大陸地表微生物的碳代謝速率低4 個數量級(J?rgensen,2011)。微生物為了適應極端環境而表現出如此緩慢的代謝能力,是否讓那些努力瘦身的人大為驚嘆呢?

如果說微生物“特種部隊”如此緩慢的代謝能力還不能讓您驚嘆的話,那么它們作為地球的“長壽之王”也許可以讓您驚奇吧,用“壽比南山”來形容它們,一點也不為過。這些嗜極微生物到底有多長壽?人們已經從年齡高達100 萬~1 億年的深部地下水或冰層中分離出了一些新發現的極端微生物,這意味著它們至少已經活了100 萬年。特別地,微生物為了適應極端環境條件可以說是“拼了老命”,往往只以芽孢的形式存在,細菌芽孢可以說是目前地球上已知的最強壯的細胞。人們已經從海底2200 萬年的沉積物乃至2.5 億年的巖鹽晶體中提取到活性芽孢(Lomstein et al.,2012)。這意味著微生物可以以芽孢的形式存活數億年。大自然到處都是謎,小小的微生物更是如此。

您也許會問:這支“特種部隊”到底有多大規模,深部生物圈到底有多大生物量?目前,對深部生物圈生物量的估算偏差很大,總體認為一般占地球生物總有機碳量的2%~19%(McMahon and Parnell,2014)。作為一支“特種部隊”,深部生物圈生物量能達到這樣的規模已經很可觀了。隨著從表層往下深度的不斷加大,總體生物量呈現出對數形式降低的趨勢。例如,在海底表層1 米的沉積物中,微生物細胞的豐度為109 個細胞/厘米3;而在深度500 米的沉積物中,微生物細胞的豐度則降低到106 個細胞/ 厘米3(Parkes et al.,2000)。

微生物在地球深部訓練出來的這支神秘“特種部隊”,對人類而言非常重要。在深部環境,一些物理化學條件往往都比較極端,因而深部生物圈代表著地球早期極端環境下的生命特征。研究深部生物圈不僅有助于人們了解地球早期的生命起源,也能為在火星等外星天體上尋找生命提供線索。研究深部生物圈還對研究油氣及礦產資源、元素地球化學循環與氣候變化、地下水資源、地下空間利用、核廢料和二氧化碳的地下儲存等都具有重要意義。例如,核廢料儲存在地下,地下微生物會蝕變儲存這些廢料的容器,從而導致核廢料擴散,有些微生物則可以分解這些核廢料,因而人們需要查明微生物對這些核廢料的正面和負面效應。

特別是,深部生物圈的微生物為了適應極端的物理化學條件,產生了一些具有特殊功能的酶,分離出這些酶就可以應用于各類工農業生產中。深海中存在嗜熱、嗜冷、嗜酸、嗜堿、嗜壓、嗜鹽等微生物,通過分離可以獲得一系列深海微生物酶,包括蛋白酶、酯酶、鹵化酶、過氧化物酶、纖維素酶、瓊膠酶、DNA 聚合酶等,它們在農業、食品、醫藥、環保、冶金、能源等領域都有著重要的應用前景。如此看來,這支“特種部隊”根本不存在“鷹老爪鈍”的現象,深部生物圈雖然遠離了人類生活的地球表層系統,卻對人類社會非常重要。人類不斷地向深部地下拓展空間,我國也已經提出了發展深地科技的國家戰略,這對揭開深部生物圈這支神秘的“特種部隊”具有非常重要的意義。

本文摘編自《演化: 微生物如何塑造地球》(謝樹成等著. 北京 : 科學出版社,2026. 3)一書“第一章 微生物創世”,標題為編者所加。

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(科學與未來 : 院士科普叢書)

ISBN 978-7-03-084146-9

責任編輯:張 莉 姚培培

我們每天都在和微生物打交道,但人類究竟對微生物了解多少?微生物到底是人類的朋友還是敵人?不同的人有著不同的答案。盡管如此,有一點可以肯定,那便是微觀尺度的微生物能夠產生宏觀尺度的效應,在龐大的地球生態系統、復雜的人體系統中都發揮著至關重要的作用。

本書聚焦微生物與地球系統的復雜關系,從創世、問天、戲水、弄石四個方面介紹微生物對地球生物圈、大氣圈、水圈和巖石圈的影響,并從尋蹤角度闡述科學家如何研究數億年、數十億年前出現在地球上的微生物。本書集科學性、知識性和趣味性于一體,生動地闡釋了各種各樣的微生物的特性,特別是它們那些鮮為人知、令人驚嘆的本領。本書有助于社會大眾了解小小的微生物如何塑造我們宜居的大地球,有益于青少年培養科學興趣、開闊思維視野,強化保護微生物多樣性、守護地球家園的責任意識。

本書適合科研工作者、大中學生以及其他對地球科學、生命科學感興趣的讀者閱讀。


(本文編輯:劉四旦)

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