包括基因編輯、免疫療法和 RNA 藥物在內的突破性療法,都需要快速、大規模的基因組分析。整合海量基因組數據和單細胞數據對于靶點發現和設計更安全的干預措施至關重要,而傳統流程往往會將研究周期拉長至數月甚至數年。
NVIDIA BioNeMo 平臺由 GPU 加速的工具、框架和 AI 模型組成,其中包括 NVIDIA Parabricks 和 NVIDIA CUDA-X Data Science(DS)庫,可大幅加速基因組學工作流。
在 GTC 大會上,NVIDIA 重點介紹了一批新興醫療與生命科學企業,它們正在借助 BioNeMo 進行數據處理和模型開發,以解鎖全新的療法突破。
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解碼神經回路:全腦尺度可視化基因組級 CRISPR 擾動;圖片由 PerturbAI 提供
- Basecamp Research 聯合 Ultima Genomics 和 PacBio 等,并依托 NVIDIA AI 基礎設施,推出 Trillion Gene Atlas(TGA)——這是一項旨在將人類對基因多樣性的認知提升百倍的生物數據采集計劃。
- Tahoe Therapeutics 構建了全球最大的單體單細胞數據集 Tahoe-100M,用于打造新的虛擬細胞模型架構。Tahoe-100M 的訓練流程完全運行在 NVIDIA Hopper GPU 上,并使用 NVIDIA cuVS 庫。Tahoe 計劃通過在 NVIDIA DGX 系統上運行并結合由 scverse 開發的 RAPIDS-singlecell 框架,將規模擴展至 10 億細胞級別。
- PerturbAI 與 NVIDIA 生物基礎模型研究團隊合作,發布了全球規模最大的體內 CRISPR 功能基因組圖譜——包含近 800 萬個全腦細胞的數據集,構建了目前在活體組織中規模最大的基因功能因果關系圖譜之一。該公司正在使用 NVIDIA CUDA-X DS 深入探索神經退行性疾病、精神疾病和代謝疾病背后的全新生物機制。
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