撰文丨王聰
編輯丨王多魚
排版丨水成文
實驗小鼠(laboratory mouse)是生物醫學研究中的關鍵模型系統,但其全身測量工具卻一直缺乏。
2026 年 3 月 27 日,復旦大學未來信息創新學院鮑峰青年研究員、芝加哥大學Nicolas Chevrier、北京航空航天大學人工智能學院Li Bohan等,在國際頂尖學術期刊Cell上發表了題為:Whole-body molecular and cellular mapping of the laboratory mouse 的研究論文。該研究成功繪制了實驗小鼠的全身分子和細胞圖譜。
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在這項最新研究中,研究團隊生成了全小鼠切片的時空轉錄組學圖譜,能夠準確捕捉組織學區域。研究團隊通過構建包含 5900 萬個單細胞的參考數據集,并結合一種可擴展的細胞類型分配計算方法,在全小鼠切片圖譜中對 379 種細胞類型進行了空間定位。此外,研究團隊利用這些全小鼠圖譜創建了一個機器學習方法——LABEL,能夠對來自 H&E 染色切片的組織學圖像進行全身組織和細胞類型的注釋。
最后,研究團隊將全小鼠空間分析應用于內毒素血癥(endotoxemia)中全身性炎癥的圖譜繪制,描繪了組織和細胞類型中基因表達程序的全組織變化。
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該研究的亮點:
6 周齡小鼠全身切片的全轉錄組譜;
LABEL 算法在 H&E 圖像上標注器官、組織和細胞類型;
全身圖譜揭示了小鼠內毒素血癥的全身性炎癥特性;
該研究提供了一種在實驗小鼠中開展全身空間分子研究的統一框架。
總的來說,這項工作為研究實驗小鼠在空間、時間和條件下的分子和細胞過程的全身性研究鋪平了道路。
論文鏈接:
https://www.cell.com/cell/abstract/S0092-8674(26)00273-4
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