當(dāng)IT男決定不讓他狗去死：ChatGPT全程輔助尋找靶點(diǎn)設(shè)計(jì)癌癥疫苗！奇跡出現(xiàn)了

防走丟，大家也可以在“事兒君看世界”找到我

關(guān)注起來，以后不“失聯(lián)”~

2025年12月，澳大利亞昆士蘭州一個(gè)叫加頓的小鎮(zhèn)，獸醫(yī)診所的操作臺(tái)上，一只名叫Rosie的狗正安靜地趴著。

她后腿上長了一個(gè)網(wǎng)球大小的腫瘤，皮毛黯淡，眼神疲倦。獸醫(yī)給她打了一針。

那針里裝的，是她主人用了將近一年時(shí)間，靠著ChatGPT和一堆數(shù)據(jù)分析工具，親手設(shè)計(jì)出來的個(gè)性化mRNA癌癥疫苗。

奇跡出現(xiàn)了。六周后，那個(gè)腫瘤縮小了將近一半。

疫苗的設(shè)計(jì)者Paul Conyngham是一名AI工程師，沒有任何生物學(xué)背景。他從沒上過醫(yī)學(xué)院，沒發(fā)表過一篇生物醫(yī)學(xué)論文。

他的專業(yè)是電氣工程和機(jī)器學(xué)習(xí)，日常工作是幫企業(yè)分析數(shù)據(jù)、搭A(yù)I系統(tǒng)。

直到他的狗狗Rosie快死了。

（Paul和Rosie）

Rosie是一只斯塔福郡斗牛梗與沙皮犬的混血，2019年被Paul從悉尼的一家動(dòng)物收容所領(lǐng)養(yǎng)回家。她是被遺棄在叢林里的，沒有人知道她之前經(jīng)歷了什么。Paul把她帶回家，剛好趕上新冠疫情封鎖，就這樣相伴度過了漫長的隔離期。

2024年，Rosie被確診為肥大細(xì)胞癌，這是犬類最常見的惡性皮膚腫瘤之一，在沙皮犬混血中尤其容易出現(xiàn)侵襲性極強(qiáng)的類型。

Paul花了數(shù)萬澳元，帶她做手術(shù)、化療、免疫治療，腫瘤被壓住了，但始終沒有縮小。

獸醫(yī)給出的預(yù)判是，只剩下一到六個(gè)月。

Paul沒有接受這個(gè)答案。

學(xué)AI也能救命！他打開了ChatGPT。

他不是要讓AI幫忙治病，他只是想讓它幫自己想清楚下一步該怎么走。

ChatGPT給出了方向：免疫療法。

（Paul和Rosie）

具體說，是針對腫瘤突變設(shè)計(jì)的個(gè)性化疫苗。它還指引Paul去聯(lián)系新南威爾士大學(xué)的Ramaciotti基因組學(xué)中心。

這家機(jī)構(gòu)是澳大利亞最大的大學(xué)基因組學(xué)實(shí)驗(yàn)室。Paul給中心主任Martin Smith發(fā)了郵件，說想給自己的狗測序。

Smith教授收到這封郵件的時(shí)候，表情大概很微妙。因?yàn)樗f經(jīng)常收到奇怪的請求，比如這個(gè)給狗做基因測序。通常情況下，他會(huì)婉拒。基因測序生成數(shù)據(jù)容易，但解讀數(shù)據(jù)極其困難，沒有專業(yè)背景根本沒法用。

Paul的回答說沒事，我是數(shù)據(jù)分析師，我會(huì)用ChatGPT搞定它的！

Smith答應(yīng)了。

（Smith在實(shí)驗(yàn)室工作）

Paul敢這樣說也是有底氣的，他有17年的機(jī)器學(xué)習(xí)和數(shù)據(jù)分析經(jīng)驗(yàn)，在人工智能領(lǐng)域有很多經(jīng)驗(yàn)，曾聯(lián)合創(chuàng)辦了科技公司，并擔(dān)任澳大利亞數(shù)據(jù)科學(xué)與人工智能協(xié)會(huì)的理事。

沒想到接下來發(fā)生的事情，讓一個(gè)生物學(xué)教授目瞪口呆。

花了3000澳元測序費(fèi)，Paul拿到了Rosie的基因組數(shù)據(jù)：一份來自血液的健康細(xì)胞DNA，一份來自腫瘤的癌變細(xì)胞DNA。他把兩份數(shù)據(jù)送進(jìn)自己搭建的一套機(jī)器學(xué)習(xí)流水線，開始逐一比對突變位點(diǎn)。

他把這個(gè)過程比喻成修車，就像拿同一臺(tái)發(fā)動(dòng)機(jī)，對比它在出廠時(shí)和跑了三十萬公里之后的狀態(tài)。哪里損壞了，一眼就能看出來。

找到突變之后，他調(diào)用了AlphaFold，是一個(gè)AI蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測工具。開發(fā)這個(gè)工具的兩人，還在2024年榮獲諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng)。

用這個(gè)來建模這些突變蛋白的三維結(jié)構(gòu)，判斷哪些突變最可能激活免疫系統(tǒng)。他再用另一套算法篩選出最具潛力的靶點(diǎn)，匹配對應(yīng)的藥物。

整套流程，他一邊做一邊查，ChatGPT是他的實(shí)時(shí)顧問。

（Paul做的狗狗癌癥3D模型）

Smith也驚呆了，這個(gè)毫無生物學(xué)背景的愛狗人士竟然破解了DNA密碼。

Paul打電話找到Smith，告訴他自己分析了數(shù)據(jù)，找到了發(fā)生突變的蛋白質(zhì)，接著確定了潛在的靶點(diǎn)，并將它們與藥物匹配。但他自己不會(huì)做藥物合成，于是問Smith能不能幫他找到實(shí)驗(yàn)室把這個(gè)藥做出來。

Smith一口答應(yīng)了！

但最大的挑戰(zhàn)也在此出現(xiàn)了。

團(tuán)隊(duì)找到了一種現(xiàn)成的免疫藥物，認(rèn)為它可能有效，于是聯(lián)系了藥企申請同情用藥。這是一種讓絕癥患者，在臨床試驗(yàn)之外獲得實(shí)驗(yàn)性藥物的機(jī)制。

藥企拒絕了。

Paul和Martin Smith沮喪地坐在一起，聊到了mRNA疫苗，這項(xiàng)在新冠疫情中被大規(guī)模推廣的技術(shù)。Smith問他：要不要往這個(gè)方向試試？

Paul轉(zhuǎn)身，開始研究mRNA。

他把所有篩選結(jié)果壓縮成半頁紙的設(shè)計(jì)方案，找到了新南威爾士大學(xué)RNA研究所所長Páll Thordarson教授。

（Paul用于創(chuàng)建 mRNA 療法的部分代碼）

Thordarson教授是冰島人，在悉尼大學(xué)拿的博士，發(fā)表過130多篇論文，獲得過澳大利亞科學(xué)院化學(xué)領(lǐng)域的最高獎(jiǎng)項(xiàng)。

他領(lǐng)導(dǎo)的UNSW RNA研究所是澳大利亞頂級(jí)的RNA研究機(jī)構(gòu)之一，也是澳大利亞價(jià)值1760萬澳元的RNA研究與培訓(xùn)網(wǎng)絡(luò)的牽頭機(jī)構(gòu)。

他看完P(guān)aul的方案，接了這個(gè)項(xiàng)目。

他的團(tuán)隊(duì)用那半頁設(shè)計(jì)，合成了一支脂質(zhì)納米粒子包裹的mRNA疫苗。從收到方案到疫苗制備完成，不到兩個(gè)月。

Thordarson后來對媒體說：

“這是歷史上第一次有人為一只狗設(shè)計(jì)個(gè)性化癌癥疫苗。這件事告訴我們，個(gè)性化醫(yī)療可以非常有效，而且可以在時(shí)間緊迫的情況下快速完成。”

他補(bǔ)充道：

“更厲害的是，整套設(shè)計(jì)是由一個(gè)沒有生物學(xué)背景的數(shù)據(jù)工程師完成的，他靠算法告訴我們該怎么構(gòu)建這支mRNA。這在過去是不可想象的”。

（新南威爾士大學(xué)RNA研究所所長Thordarson）

但還有一道關(guān)卡沒過：倫理審批。

在澳大利亞，任何實(shí)驗(yàn)性藥物必須經(jīng)過嚴(yán)格的倫理審查才能用于動(dòng)物。Paul花了三個(gè)月，每天下班后工作兩小時(shí)，寫完了一份一百頁的申請文件。

他覺得這些走過場的手續(xù)，比研究本身還耗費(fèi)精力。

但正當(dāng)他為倫理審批焦頭爛額的時(shí)候，命運(yùn)再次幫了他一把。

遠(yuǎn)在美國華盛頓州貝爾維尤市，有一個(gè)叫Mari Maeda的女人。她曾是美國國防部高級(jí)研究項(xiàng)目局的項(xiàng)目經(jīng)理，MIT博士，在連續(xù)失去三只狗之后，創(chuàng)辦了非營利機(jī)構(gòu)犬類癌癥聯(lián)盟。

她在瀏覽UNSW的新聞時(shí)，偶然看到了Paul的故事，隨即把他介紹給了昆士蘭大學(xué)獸醫(yī)學(xué)院的Rachel Allavena教授。

Allavena是一位專門研究犬類免疫療法的獸醫(yī)病理學(xué)家，在加頓的診所已經(jīng)給170多只患癌的狗做過實(shí)驗(yàn)治療，其中五分之一的腫瘤完全消失。

（獸醫(yī)學(xué)院的獸醫(yī)病理專家 Rachel Allavena）

更關(guān)鍵的是，她已經(jīng)有現(xiàn)成的倫理審批框架，可以直接覆蓋Paul設(shè)計(jì)的這支疫苗。

三個(gè)月的審批焦慮，就這樣被一封陌生人的郵件解決了。

2025年12月，Paul開車帶著Rosie，走了整整十個(gè)小時(shí)，抵達(dá)加頓。

Rosie接受了第一針注射。

2026年2月，第二針。3月，第三針。

結(jié)果超出了所有人的預(yù)期。

那個(gè)一直壓在Rosie后腿上的網(wǎng)球大小的腫瘤，開始縮小，大概縮小了一半！

最大的那顆縮小了將近75%。Rosie的毛發(fā)開始變得光澤，精力恢復(fù)，會(huì)在公園里撒歡，某天甚至跳過籬笆去追一只兔子。

Paul說：“12月她還沒有精力，腫瘤壓得她喘不過氣，六周后她已經(jīng)在狗公園跳欄追兔子了！”

病理學(xué)家Allavena對著鏡頭說：“當(dāng)它第一次發(fā)生的時(shí)候，就是魔法。”

（Rosie注射疫苗后，從左至右：2025年11月，試驗(yàn)開始前。

2025年12月，mRNA注射后一周。

2026年1月，試驗(yàn)進(jìn)行七周后。

2026年3月，現(xiàn)在的恢復(fù)狀況。）

Rosie 的治療還沒有結(jié)束。

雖然第一支個(gè)性化mRNA癌癥疫苗已經(jīng)讓她體內(nèi)的部分腫瘤明顯縮小，但仍有一顆較大的腫瘤幾乎沒有反應(yīng)。因此，Paul和新南威爾士大學(xué)的研究團(tuán)隊(duì)決定繼續(xù)推進(jìn)第二輪治療，為這顆頑固的腫瘤專門設(shè)計(jì)一支新的疫苗。

UNSW 的科學(xué)家們已經(jīng)開始進(jìn)行新一輪基因測序。

這背后涉及癌癥研究中的一個(gè)重要問題，腫瘤異質(zhì)性。

簡單來說，同一個(gè)身體里的不同腫瘤，甚至同一個(gè)腫瘤內(nèi)部的不同區(qū)域，都可能擁有不同的基因突變。因此，一種針對某些突變設(shè)計(jì)的疫苗，可能對部分腫瘤有效，卻對另外一些不起作用。

通過重新測序那顆沒有反應(yīng)的腫瘤，研究人員希望找到新的突變位點(diǎn)，從而設(shè)計(jì)出第二支、更有針對性的疫苗。

Paul 認(rèn)為，這種模式也許代表著未來癌癥治療的一種方向。癌癥治療也許可以像軟件更新一樣，隨著腫瘤不斷產(chǎn)生新的突變，醫(yī)生和研究人員也不斷推出新的“補(bǔ)丁”。

Paul很努力，Rosie也很幸運(yùn)。

Paul他有17年機(jī)器學(xué)習(xí)經(jīng)驗(yàn)，會(huì)編程，懂統(tǒng)計(jì)，能讀懂測序數(shù)據(jù)，這是前提。但僅憑這些，他無法獨(dú)立完成這件事。

他能做到，是因?yàn)榇丝糖『糜幸慌ぞ咄瑫r(shí)成熟到了可以被非生物學(xué)家使用的程度。

ChatGPT可以把復(fù)雜的文獻(xiàn)翻譯成可執(zhí)行的操作步驟；AlphaFold可以預(yù)測任意蛋白質(zhì)的三維結(jié)構(gòu)；基因測序的成本在過去十年里下降了幾個(gè)數(shù)量級(jí)。他花了3000澳元，在二十年前這個(gè)數(shù)字是幾百萬。

他能做到，還因?yàn)樗龅搅嗽敢庀嘈潘目茖W(xué)家：一個(gè)被他的堅(jiān)持打動(dòng)的基因組學(xué)教授，一個(gè)冰島來的納米醫(yī)學(xué)專家，一個(gè)在偏遠(yuǎn)小鎮(zhèn)做著犬類免疫治療的女科學(xué)家。任何一個(gè)人說不，可能都不止是翻倍的困難。

UNSW分子腫瘤學(xué)中心主任David Thomas說，這件事打動(dòng)他的，是一個(gè)普通人，用他的計(jì)算機(jī)技能，參與到了科學(xué)進(jìn)程里。

（Paul和Rosie）

這個(gè)故事還有一層特殊的意義。

Thordarson教授在電視節(jié)目里說：

“我們完全可以在澳大利亞做到這件事。我們不需要依賴外國公司，我們可以讓這項(xiàng)技術(shù)在澳大利亞民主化。”

現(xiàn)在全球有超過120項(xiàng)RNA癌癥疫苗的臨床試驗(yàn)正在進(jìn)行。Moderna和默克共同研發(fā)的mRNA-4157/V940，在黑色素瘤患者中將復(fù)發(fā)風(fēng)險(xiǎn)降低了49%，預(yù)計(jì)2027年到2029年之間會(huì)有個(gè)性化癌癥疫苗正式上市，屆時(shí)每名患者的費(fèi)用可能高達(dá)10萬到30萬美元。

Rosie的疫苗，測序花了3000澳元，AI工具基本免費(fèi)，加上Paul和其他人合力的數(shù)百小時(shí)時(shí)間。

Paul在網(wǎng)上上放了一個(gè)表單，邀請有同樣需求的狗主人登記，希望能讓所有有同樣困擾的鏟屎官，都能負(fù)擔(dān)得起自己心愛狗狗的治療費(fèi)用。

科學(xué)家們甚至覺得，如果能為一只狗做到這件事，那也有機(jī)會(huì)把它推廣到所有癌癥患者身上。

因?yàn)镽osie現(xiàn)在還活著，

還在歡快的追著兔子。

ref:

https://www.theaustralian.com.au/business/technology/tech-boss-uses-ai-and-chatgpt-to-create-cancer-vaccine-for-his-dying-dog/news-story/292a21bcbe93efa17810bfcfcdfadbf7

自語貓小姐:真是一個(gè)Ai造福人類的故事

白明深:真不真假不假的希望我有這種勇氣。至今沒有做好準(zhǔn)備養(yǎng)狗，因?yàn)橐欢ㄒ龊脼閠a負(fù)責(zé)一生的準(zhǔn)備(只能到處蹭人家的狗摸！好想要小狗啊！

什么時(shí)候輪到我好運(yùn)多多 :希望Rosie可以更快樂更健康地去追逐兔子

鈴鈴鈴鈴___ :會(huì)用的話ai真的很厲害??