在組織病理學中,免疫組化是廣泛使用的診斷和檢測方法,過去幾十年里,這種基于抗體的技術被認為是癌癥診斷的金標準工具,為各種腫瘤的免疫治療提供有價值的信息。然而免疫組化存在①主觀因素造成的不同判別差異,②定量的不精確性和檢測靶標數量有限等不足。這些局限性導致對復雜的腫瘤微環境中無法進行更深層次的研究。
![]()
在這種背景下,多重免疫組化和多重免疫熒光技術應運而生,并得到越來越多地關注。2026年3月,王光川、陳洛南、景乃禾等團隊合作在Cell雜志發表題目為CLIM-TIME identifies metastatic microenvironment modulators for T cell therapy response的論文。該研究解決腫瘤免疫領域長期存在的痛點:如何高通量、因果性地解析腫瘤抑制基因(TSG)缺失如何重塑轉移性微環境,進而決定 T 細胞治療的響應?
![]()
過去看腫瘤微環境,多是相關性分析,看到某種基因突變伴隨某種免疫表型,但很難說清誰是因、誰是果。而CLIM-TIME平臺通過整合CRISPR篩選、激光捕獲顯微切割(LCM)和空間轉錄組技術,真正實現了從基因型到免疫表型的因果映射。
![]()
傳統的CRISPR篩選往往是將整個腫瘤打碎測序,丟失了空間信息。CLIM-TIME利用熒光標記的單克隆轉移灶,結合LCM技術,精確捕獲3000多個獨立的轉移克隆進行SMART-seq測序。這不僅保留了sgRNA信息,還獲得該克隆及其周圍微環境的完整轉錄組。
![]()
基于這種高精度的數據,研究人員沒有籠統地談冷或熱腫瘤,而是精細地定義七種轉移性TME亞型。從CD4/CD8雙浸潤型,到髓系富集但T細胞排斥型(M-II/T-IE),再到免疫荒漠型。這種分類讓我們看到,不同的TSG缺失(如DNA修復基因 vs. Hippo通路基因)會驅動截然不同的轉錄程序,塑造出完全不同的免疫生態位。
![]()
表型層面。研究發現,DNA損傷修復(DDR)和Polycomb復合物(PRC) 基因的缺失,傾向于形成T細胞浸潤型TME,這類腫瘤對T細胞治療敏感。相反,Hippo-YAP通路(如Nf2, Lats1/2)基因的缺失,則強力驅動免疫逃逸,形成髓系富集、T 細胞被物理排斥的冷腫瘤,導致治療抵抗。
![]()
機制層面。研究鎖定關鍵效應分子,LOXL2(賴氨酰氧化酶樣蛋白2)。YAP可直接結合并上調Loxl2表達。LOXL2作為交聯酶,可催化膠原蛋白的過度交聯,導致ECM硬度增加、致密化。
![]()
轉化層面。抑制LOXL2(使用抑制劑PXS5505)聯合 T 細胞治療(如CAR-T),在多種難治性轉移模型中均能顯著延長生存期。這為克服實體瘤免疫治療抵抗提供一個極具前景的聯合策略:降解ECM+T 細胞治療。
![]()
這項研究創造性地將體內CRISPR篩選與空間分辨的轉錄組學結合起來。以前的篩選只能提示哪個基因重要,CLIM-TIME則全面呈現這個基因缺失后,腫瘤長什么樣、周圍有什么細胞、細胞間怎么對話。這是一種范式轉移,為研究基因型-微環境互作樹立了新標桿。
特別聲明:以上內容(如有圖片或視頻亦包括在內)為自媒體平臺“網易號”用戶上傳并發布,本平臺僅提供信息存儲服務。
Notice: The content above (including the pictures and videos if any) is uploaded and posted by a user of NetEase Hao, which is a social media platform and only provides information storage services.