中國人群泛癌基因變異圖譜，揭示真實世界臨床測序與精準診療特征

精準腫瘤學的核心在于通過系統分析患者的分子特征譜，識別出驅動腫瘤發生發展和臨床診治的關鍵基因組變異。當前，全球范圍內已開展大量臨床腫瘤基因組學研究，但主要以西方人群為核心，亞洲人群尤其是中國人群數據缺乏，導致現有數據難以充分反映真實世界臨床檢測的中國患者診療特征。因此，構建大規模、高質量的中國人群泛癌真實世界基因組數據，系統解析其分子特征與臨床診療結局，是推進我國惡性腫瘤精準診治的迫切需求。

2026年1月16日，中國醫學科學院腫瘤醫院李文斌、應建明教授團隊在國際期刊Interdisciplinary Medicine在線發表題為“Chinese pan‐cancer patient genomic characteristics: A comprehensive analysis based on the National Cancer Center—Clinical Diagnostics Knowledgebase real‐world clinical sequencing cohort”的研究論文。該研究構建國內首個大規模泛癌真實世界基因組數據庫NCC-CLINDx，匯集2018年1月至2024年6月期間在中國醫學科學院腫瘤醫院接受NGS基因檢測的6858例患者的6935對腫瘤-正常配對樣本，覆蓋54種常見腫瘤類型、270余種亞型，以非小細胞肺癌（34.4%）、結直腸癌（25.0%）、胃腺癌（5.3%）等臨床高發腫瘤為主，隊列特征在一定程度上反映了中國臨床腫瘤患者的真實分布情況。研究采用涵蓋520個腫瘤相關基因的靶向測序panel，通過嚴格質量控制和標準化分析流程，確保數據可靠性和基因變異檢測準確性。

在該隊列中，TP53（57.8%）、APC（22.6%）、KRAS（21.3%）和EGFR（17.5%）為高頻突變基因，其中TP53失活突變在食管鱗癌、小細胞肺癌、肺鱗癌等多種腫瘤中頻率超過80%。RTK-RAS（70.9%）、TP53（64.6%）、WNT（35.6%）和PI3K（35.1%）通路失調最為顯著，同時隊列中14.9%的樣本具有高腫瘤突變負荷（TMB≥10個突變/Mb），3.3%的患者微衛星高度不穩定（MSI-H），且MSI-H樣本的TMB水平顯著高于微衛星穩定樣本。

與美國MSK-MET隊列（20263例白種人樣本）及中國OrigiMed隊列的跨人群水平對比，發現顯著的種族特異性分子差異：中國肺腺癌患者EGFR突變率（48.5%）顯著高于西方白人（23.7%），而西方人群則以KRAS高突變（37.1% vs. 11.1%）為特征；膽管癌中，白人IDH1突變率更高，中國患者則以TP53突變富集為特點；肺鱗癌中，中國患者KMT2D和FAT1基因突變率顯著高于西方人群，表明這些基因可能在中國肺鱗癌患者中具有獨特的致癌驅動作用。此外，70.2%的中國患者攜帶至少1個具有潛在臨床意義的基因組變異，其中肺腺癌、子宮內膜癌和胰腺癌患者具有潛在臨床意義的基因突變比例最高，提示中國人群可接受靶向治療比例較高。

研究還驗證了NGS與傳統分子病理檢測技術方法（IHC/FISH）的一致性，發現NGS檢測ERBB2局灶性擴增與HER2陽性狀態（IHC 3+或FISH+）之間存在密切關聯。在肺腺癌中，ERBB2局灶性擴增患者（1.4%）通常伴隨高頻率TP53突變（93%），部分患者在EGFR靶向治療耐藥后接受HER2抗體偶聯藥物（ADC）治療獲得疾病控制，提示HER2靶向方案可為該類肺腺癌患者帶來明確臨床獲益。此外，非小細胞肺癌中NGS檢測ALK重排與免疫組化驗證結果高度一致，為優化多平臺聯合檢測策略提供了實證依據。

本研究建立的NCC-CLINDx基因組數據，是國內率先依托院內真實世界臨床診療體系構建的跨癌種、大規模靶向測序隊列，系統揭示中國人群泛癌基因組特征，為針對中國患者的生物標志物驅動型臨床試驗設計提供關鍵的分子證據。研究還發現，將NGS檢測與傳統分子病理檢測方法相結合，可優化不同腫瘤類型中基因組變異的檢測閾值與臨床診療標準。未來，隨著隊列中臨床隨訪數據的完善及AI病理圖像、轉錄組等多組學數據的整合，NCC-CLINDx將進一步推動腫瘤分子特征與治療療效、預后的關聯分析，為腫瘤精準診治提供更全面支撐。

中國醫學科學院北京協和醫學院/中國醫學科學院腫瘤醫院病理科李文斌、應建明教授為本文的共同通訊作者，碩士研究生李鴻瑞、病理科王順醫生為共同第一作者。本研究得到國家重點研發計劃（2022YFC2409902）、國家自然科學基金（82541023、82203405）、北京市自然科學基金（JQ24045）、首都衛生發展科研專項（2024-2-40211）、中國癌癥基金會北京希望馬拉松專項基金（LC2022L02）、中國醫學科學院醫學與健康科技創新工程（2023-I2M-C&T-B-083）、中國醫學科學院中央級公益性科研院所基本科研業務費（2023-JKCS-07）等項目資助。

原文鏈接：https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/inmd.70087